Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC137Q6PK04 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC137Q6PK04 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms