Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK3Q6PHR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK3Q6PHR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms