Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFWD3Q6PCD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFWD3Q6PCD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFWD3Q6PCD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFWD3Q6PCD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms