Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF549Q6P9A3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF549Q6P9A3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF549Q6P9A3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms