Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIPAL3Q6P499 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPAL3Q6P499 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL3Q6P499 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPAL3Q6P499 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms