Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGMBQ6NW40 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGMBQ6NW40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGMBQ6NW40 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RGMBQ6NW40 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGMBQ6NW40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGMBQ6NW40 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGMBQ6NW40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGMBQ6NW40 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms