Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB12Q6IQ22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms