Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL6Q6ICC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL6Q6ICC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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