Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPH2Q6IBW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPH2Q6IBW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPH2Q6IBW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCAPH2Q6IBW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPH2Q6IBW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms