Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC19Q6DKK2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC19Q6DKK2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC19Q6DKK2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms