Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CREB3L3Q68CJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CREB3L3Q68CJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CREB3L3Q68CJ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms