Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM236Q5W0B7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM236Q5W0B7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms