Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q5VSD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q5VSD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q5VSD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q5VSD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5VSD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5VSD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5VSD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5VSD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5VSD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5VSD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q5VSD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5VSD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5VSD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5VSD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5VSD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5VSD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q5VSD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q5VSD8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q5VSD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q5VSD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q5VSD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5VSD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q5VSD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5VSD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5VSD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5VSD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5VSD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q5VSD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q5VSD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q5VSD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q5VSD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q5VSD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q5VSD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q5VSD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q5VSD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q5VSD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q5VSD8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q5VSD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q5VSD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q5VSD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q5VSD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q5VSD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q5VSD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q5VSD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q5VSD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q5VSD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q5VSD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q5VSD8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5VSD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5VSD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5VSD8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5VSD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5VSD8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5VSD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5VSD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5VSD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5VSD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5VSD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5VSD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5VSD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5VSD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5VSD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5VSD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5VSD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5VSD8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5VSD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5VSD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5VSD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5VSD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms