Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN9Q5TKA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIN9Q5TKA1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms