Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA5B1Q5TIE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA5B1Q5TIE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B1Q5TIE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA5B1Q5TIE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms