Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4J0

GCNT6, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT6Q5T4J0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT6Q5T4J0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT6Q5T4J0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT6Q5T4J0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT6Q5T4J0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT6Q5T4J0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT6Q5T4J0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNT6Q5T4J0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT6Q5T4J0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT6Q5T4J0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT6Q5T4J0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT6Q5T4J0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT6Q5T4J0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNT6Q5T4J0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms