Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNYL2Q5T2Q4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNYL2Q5T2Q4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL2Q5T2Q4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL2Q5T2Q4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms