Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CEP170Q5SW79 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CEP170Q5SW79 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CEP170Q5SW79 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CEP170Q5SW79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP170Q5SW79 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP170Q5SW79 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CEP170Q5SW79 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CEP170Q5SW79 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CEP170Q5SW79 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CEP170Q5SW79 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CEP170Q5SW79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CEP170Q5SW79 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms