Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HP1BP3Q5SSJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HP1BP3Q5SSJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms