Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNFT1Q5M7Z0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms