Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NLQ5JXB2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NLQ5JXB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms