Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB2Q5IJ48 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB2Q5IJ48 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms