Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOM1Q5C9Z4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NOM1Q5C9Z4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOM1Q5C9Z4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms