Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf116Q5BN46 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf116Q5BN46 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 622.7 ms