Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLE1Q53GS7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GLE1Q53GS7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLE1Q53GS7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLE1Q53GS7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms