Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NCBP3Q53F19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCBP3Q53F19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCBP3Q53F19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCBP3Q53F19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NCBP3Q53F19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCBP3Q53F19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCBP3Q53F19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCBP3Q53F19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCBP3Q53F19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms