Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC23Q53EV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC23Q53EV4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms