Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBRG1Q3YBR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBRG1Q3YBR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms