Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM12Q3MHD2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM12Q3MHD2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM12Q3MHD2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms