Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR2Q16832 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR2Q16832 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR2Q16832 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms