Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF9Q16594 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF9Q16594 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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