Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms