Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1AQ15573 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1AQ15573 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1AQ15573 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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