Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23BQ15437 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23BQ15437 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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