Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3A2Q15428 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3A2Q15428 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3A2Q15428 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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