Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCM1Q15154 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCM1Q15154 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
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