Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCF4Q15080 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCF4Q15080 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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