Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAB3GAP1Q15042 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RAB3GAP1Q15042 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAB3GAP1Q15042 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
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