Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC3Q15034 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC3Q15034 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERC3Q15034 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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