Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERPUD1Q15011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERPUD1Q15011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERPUD1Q15011 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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