Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB39AQ14964 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39AQ14964 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB39AQ14964 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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