Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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