Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BECN1Q14457 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BECN1Q14457 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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