Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM25Q14258 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM25Q14258 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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