Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNX2Q13950 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX2Q13950 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX2Q13950 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX2Q13950 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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