Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF9Q13886 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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