Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCOA4Q13772 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA4Q13772 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NCOA4Q13772 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCOA4Q13772 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
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