Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTM1Q13496 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTM1Q13496 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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