Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TCOF1Q13428 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TCOF1Q13428 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
TCOF1Q13428 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TCOF1Q13428 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TCOF1Q13428 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms