Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
TARBP1Q13395 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TARBP1Q13395 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TARBP1Q13395 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
TARBP1Q13395 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TARBP1Q13395 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TARBP1Q13395 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TARBP1Q13395 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TARBP1Q13395 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
TARBP1Q13395 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TARBP1Q13395 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
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