Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-KCTD14-204ENST00000614236 386 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-202ENST00000525085 495 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 LDHA-207ENST00000460405 680 ntTSL 312.56□□□□□ -0.41e-15■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLTC-211ENST00000579815 609 ntTSL 57.54□□□□□ -1.29e-11■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PSMD14-202ENST00000437630 577 ntTSL 513.15□□□□□ -0.37e-7■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.77□□□□□ -1.495e-23■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CCAR2-204ENST00000520536 2173 ntTSL 221.46■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MCM7-212ENST00000493352 533 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 EIF4A3-206ENST00000575978 3593 ntTSL 210.02□□□□□ -0.817e-7■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.175e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 SLC25A1-203ENST00000461267 804 ntTSL 328.9■■■□□ 2.225e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-207ENST00000532279 552 ntTSL 328.35■■■□□ 2.135e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.115e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 25e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-222ENST00000576677 1926 ntTSL 1 (best)26.94■■□□□ 1.95e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.795e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GSTM3-205ENST00000488824 1118 ntTSL 225.91■■□□□ 1.745e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.655e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-204ENST00000526510 1677 ntTSL 1 (best)24.51■■□□□ 1.515e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-209ENST00000572794 1380 ntTSL 224.26■■□□□ 1.475e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 223.82■■□□□ 1.45e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.45e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLIP2-206ENST00000487091 989 ntTSL 1 (best)23.61■■□□□ 1.375e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.265e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.235e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.235e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-208ENST00000532446 1465 ntTSL 522.26■■□□□ 1.155e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GNB2-208ENST00000431068 910 ntTSL 521.24■□□□□ 0.995e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-208ENST00000572389 776 ntTSL 221.21■□□□□ 0.995e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-223ENST00000576691 929 ntTSL 320.84■□□□□ 0.935e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 NUP160-207ENST00000528501 1961 ntTSL 220.79■□□□□ 0.925e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-221ENST00000576603 765 ntTSL 319.31■□□□□ 0.685e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-220ENST00000576432 684 ntTSL 219.31■□□□□ 0.685e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-209ENST00000537694 882 ntTSL 518.83■□□□□ 0.65e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-218ENST00000575132 707 ntTSL 518.3■□□□□ 0.525e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 518.12■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.485e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-226ENST00000577051 979 ntTSL 517.59■□□□□ 0.415e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 SOGA1-203ENST00000463491 802 ntTSL 217.56■□□□□ 0.45e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.295e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.245e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.195e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLIP2-209ENST00000493166 561 ntTSL 415.84■□□□□ 0.135e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 215.24■□□□□ 0.035e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 RTCB-202ENST00000463455 628 ntTSL 214.7□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MYO10-212ENST00000515803 4839 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.096e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.196e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MYO10-203ENST00000505695 4803 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.26e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.255e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 RRP7A-201ENST00000323013 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 HIST1H2BB-201ENST00000615966 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.315e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 PPP1CA-205ENST00000527663 765 ntTSL 312.11□□□□□ -0.475e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 ARID1A-203ENST00000430291 580 ntTSL 411.21□□□□□ -0.612e-11■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.786e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.925e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GSTM3-203ENST00000476321 742 ntTSL 39.24□□□□□ -0.935e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 RTCB-205ENST00000487704 767 ntTSL 29.17□□□□□ -0.945e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 GSTM3-204ENST00000486823 783 ntTSL 27.91□□□□□ -1.145e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.245e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 26.79□□□□□ -1.325e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TSG101-211ENST00000580814 441 ntTSL 26.3□□□□□ -1.45e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-229ENST00000637208 8283 ntTSL 56.08□□□□□ -1.445e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.595e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.615e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.625e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-231ENST00000637255 4071 ntTSL 54.83□□□□□ -1.645e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.645e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.685e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.745e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 MAGED2-211ENST00000487482 341 ntTSL 24.13□□□□□ -1.755e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.545e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-211ENST00000497582 1075 ntTSL 327.88■■■□□ 2.055e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.575e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-206ENST00000435310 507 ntTSL 219.84■□□□□ 0.775e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.325e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-210ENST00000495205 971 ntTSL 516.11■□□□□ 0.175e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-207ENST00000455367 487 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-205ENST00000414605 545 ntTSL 213.38□□□□□ -0.275e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 212.64□□□□□ -0.395e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 SUPT6H-206ENST00000581510 1194 ntTSL 521.39■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 SUPT6H-208ENST00000583340 581 ntTSL 310.59□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 22.5
G3BP1Q13283 LDHA-222ENST00000543695 554 ntTSL 513.64□□□□□ -0.231e-15■■■■□ 22.4
G3BP1Q13283 MYBBP1A-205ENST00000571368 1995 ntTSL 222.5■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 22.4
G3BP1Q13283 MYBBP1A-211ENST00000574547 1607 ntTSL 1 (best)21.89■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 22.4
G3BP1Q13283 MYBBP1A-206ENST00000572759 588 ntTSL 320.04■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 22.4
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